#iGEM 2022

[tragic-media]

Chennai engineering college students win gold at international competition

Gayathri Vijayakumar, associate professor of Biotechnology in the college, which is affiliated to the Anna University, said International Genetically Engineered Machine (iGEM) Foundation, an independent, non-profit organisation, held the competition in synthetic biology.

Called Curlim, the project aimed to remove toxic cadmium ions from industry effluents using genetic engineering and synthetic biology tools. The team genetically engineered escerichia coli bacteria and modified its DNA. The bacteria can precipitate cadmium ions from the effluent (wastewater from industries) by expressing the enzyme acid phosphatase on the membrane, Ms. Gayathri said.

“We got the best environment track award. Under the environmental track, 50 teams from across the world submitted projects. From India, there were 14 teams — 12 were from national institutes like IITs, IISER and IISc Bengaluru. The two private entries were from VIT Vellore and Rajalakhsmi Engineering College, Chennai,” she added.

The shortlisted teams included those from the USA, the UK, Lithuania, China and India.Read More

[trustednewstribune]

Chennai engineering college students win gold at international competition

Gayathri Vijayakumar, associate professor of Biotechnology in the college, which is affiliated to the Anna University, said International Genetically Engineered Machine (iGEM) Foundation, an independent, non-profit organisation, held the competition in synthetic biology.

Called Curlim, the project aimed to remove toxic cadmium ions from industry effluents using genetic engineering and synthetic biology tools. The team genetically engineered escerichia coli bacteria and modified its DNA. The bacteria can precipitate cadmium ions from the effluent (wastewater from industries) by expressing the enzyme acid phosphatase on the membrane, Ms. Gayathri said.

“We got the best environment track award. Under the environmental track, 50 teams from across the world submitted projects. From India, there were 14 teams — 12 were from national institutes like IITs, IISER and IISc Bengaluru. The two private entries were from VIT Vellore and Rajalakhsmi Engineering College, Chennai,” she added.

The shortlisted teams included those from the USA, the UK, Lithuania, China and India.Read More

[rnewspost]

University adopts INTEGRA pipettes

University adopts INTEGRA pipettes

Students of Technische Universität Braunschweig, Germany, used INTEGRA Biosciences’ VIAFLO electronic pipettes and EVOLVE manual pipettes to perform sample transfers and dilutions as part of their project for the 2022 iGEM competition. The pipettes helped the team to speed up liquid handling and increase pipetting accuracy, giving the students a competitive edge over their peers. The iGEM…

[astratv]

Λάρισα: Βραβεύτηκε για την πρωτιά της στον παγκόσμιο διαγωνισμό συνθετικής βιολογίας η ομάδα της iGEM Thessaly 2022 (φώτο

Η ερευνητική ομάδα φοιτητών iGEM Thessaly 2022 εκπροσωπώντας για 4η συνεχόμενη χρονιά το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας στον παγκόσμιο διαγωνισμό συνθετικής βιολογίας iGEM (international Genetically Engineered Machine) απέσπασε όχι μόνο την πρωτιά στον κλάδο της αλλά και υποψηφιότητες σε πολλά ειδικά βραβεία. Παρουσιάζοντας το project ‘’Navanthus’’ στον τελικό του παγκόσμιου διαγωνισμού η iGEM Thessaly…

[thangnguyen35]

IGEMS – Phương Pháp Học Tiếng Anh Từ Số 0 Hiệu Quả

https://hoctienganh1kem1online.blogspot.com/2022/11/igems-phuong-phap-hoc-tieng-anh-tu-so-0.html

[don-lichterman]

Nominations Open for the First Annual Filmocracy Awards

Nominations Open for the First Annual Filmocracy Awards

Vote online to recognize excellence among festivals, distribution companies, sales agents and other unsung industry trailblazers LIQUID MEDIA GROUP (NASDAQ:YVR) LOS ANGELES, CA, UNITED STATES, November 10, 2022 /EINPresswire.com/ — The Filmocracy Awards, presented by iGEMS (a Liquid Media Group company), is proud to open the call for entries for the first annual Filmocracy Awards. Filmocracy has…

[aaltohelsinki]

A gold medal for QBlock

The last few weeks passed by in a blink of an eye. We had the wiki freeze in which all our final data and contributions of our project are stored now. You can find our wiki page here: https://2022.igem.wiki/aalto-helsinki/index.html. 

But in addition to writing constantly for several days and uploading everything to the wiki page, we were also preparing for our final presentation at the Grand Jamboree. We prepared the presentation and were fortunate enough to present it to not only our PIs and advisors, but also to the previous Aalto-Helsinki teams, which provided us with helpful feedback to improve our presentation. We were e.g. advised to keep the storyline, omit additional information and focus to convince the judges of our project. With all this fantastic help, we were able to assemble a presentation that we could be proud of. However, while working on the presentation we also worked on the design and content of our poster, which would be displayed on a screen in our booth during the Grand Jamboree. The poster was designed to be interactive and you could retrieve information based on the steps you wanted to refer to (picture below). 

We spent nearly a week in Paris and attended the Grand Jamboree, where we got to know many different iGEM teams. The Grand Jamboree was only a week ago, but already seems like a haze. Our team was attending it for three days with a full programme in which we attended workshops, networking events, presentations of other teams, booths of other teams and presented our own projects to people visiting our booth. The atmosphere at the expo was very welcoming and friendly! During both the expo pitching and judging session we were able to show the impact of our project and the work we have performed in the last 9 months to realise our project. Our work convinced the judges and we were awarded with a gold medal for our work, which was the goal that we set in the beginning of our iGEM project! Receiving this award was surreal, since it somehow determined the end of this wonderful and stressful project, but also relieving, because we achieved what we set out. 

In general, the Grand Jamboree was a fantastic event, because we were surrounded by innovation and it was shown again what broad field synthetic biology is by the diversity of projects from 356 different teams around the world. We were able to learn a lot from this competition and also think about both local and global problems differently as we were shown new ways of solving them. It was especially wonderful to see the University of Copenhagen team win the iGEM competition in the overgrad division, which had a lot of support from our PI Markus Linder. 

So, is iGEM over for us now? At least the Grand Jamboree has passed, but iGEM has not fully finished for us. We are going to present at one of the events of this year’s Slush and besides that we will assemble a new team of pioneers in iGEM to continue the Aalto-Helsinki team. Even though the Aalto-Helsinki show must go on, we will stay friends for iGEM brought us together and our Aalto-Helsinki team turned us into friends. 

Thank you for reading our blog this far and accompanying us, the Aalto-Helsinki 2022 team on our iGEM journey. We encourage you to be part of the Aalto-Helsinki 2023 team and can’t wait to have the Aalto-Helsinki team continue the journey!

-----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Viime viikot ovat kiitäneet ohi silmänräpäyksessä. Tämän vuoden iGEM-projektien wiki-sivut jäädytettiin hetki sitten, joten käykää ihmeessä tutustumassa meidän wikiimme osoitteessa https://2022.igem.wiki/aalto-helsinki/index.html.

Samalla kun ahkeroimme wiki-sivun parissa, valmistauduimme myös esittämään työmme Grand Jamboree-loppukonferenssissa. Ennen Pariisiin lähtöä saimme kuitenkin mahdollisuuden esittää lopullisen esityksemme niin meitä auttaneille PI:lle ja advisoreille kuin myös Aalto-Helsinki -alumneille, mikä auttoi meitä hiomaan vielä viimeiset yksityiskohdat paikalleen. Saamiemme vinkkien perusteella päädyimme keskittymään esityksen tarinallisuuteen sekä siihen, että projektimme vakuuttaa tuomarit haluamallamme tavalla. Lopulta käsissämme oli esitys, josta pystyimme todella olemaan ylpeitä. Esityksemme viimeistelyn lisäksi työn alla oli myös konferenssiständillä esille laitettava, interaktiivinen posteri (kuvassa).

Vietimme lähes viikon Pariisissa Grand Jamboree -konferenssimatkalla, jonka aikana tapasimme lukemattoman määrän muita iGEM-tiimejä. Vaikka Grand Jamboreesta on ehtinyt vierähtää vasta viikko, koko matka tuntuu jo hieman utuiselta. Tiimimme osallistui konferenssiin kaikkina kolmena päivänä, jotka sisälsivät mm. erilaisia työpajoja, verkoistoitumista, muiden tiimien esitysten seuraamista sekä heidän ständeillään vierailua ja yleistä ajatusten vaihtoa. Tunnelma konferenssihallissa oli todella lämminhenkinen ja vastaanottavainen! Sekä ständillä tekemämme pitchauksen sekä tuomarointisession aikana pystyimme näyttämään kaiken sen, mitä olemme valmistelleet nämä viimeiset 9 kuukautta. Kaikesta päätelle projektimme vakuutti tuomarit, sillä saimme lopulta mitaleista kirkkaimman! Olimme asettaneet kultamitalin tavoitteeksemme jo projektin alussa, joten oli huikeaa saavuttaa se, minkä eteen olemme tehneet kovasti töitä.

Kokonaisuudessaan Grand Jamboree oli upea tapahtuma, sillä pääsimme sukeltamaan hetkeksi innovaatioiden maailmaan ja näimme jälleen, kuinka laaja-alaisesti synteettistä biologiaa voi soveltaa. Tämän vuoden iGEM-tiimien osallistujamäärä oli 356, mikä takasi suuren kirjon erilaisia projekteja. Tämä kilpailu oli ainutkertainen kokemus, joka opetti meille kaikille paljon. Lisäksi oli hienoa päästä todistamaan kilpailun sisäisiä menestystarinoita, kuten overgrad-sarjan voittajaa, University of Copenhagen-tiimiä, jonka projektissa PI:mme Markus Linder on toiminut suurena apuna.

Onko iGEM siis osaltamme nyt ohi? Grand Jamboreesta puhuttaessa kyllä, mutta muuten meillä on vielä hieman iGEM-aiheista tekemistä edessä. Tulemme esimerkiksi esiintymään muutaman viikon päästä pidettävässä Slushissa, jonka lisäksi tehtävänämme on rekrytä ensi vuoden Aalto-Helsinki -tiimi. Vaikka Aalto-Helsinki jatkaa ensi vuonna uudella kokoonpanolla, meidän tiimimme tulee jatkamaan matkaa ystävinä myös iGEMin jälkeen.

Koko Aalto-Helsinki 2022 tiimimme haluaa kiittää teitä kaikkia matkaamme seuranneita. Ehkä sinusta voisi tulla osa ensi vuoden tiimiä? Maltamme tuskin odottaa, että pääsemme todistamaan Aalto-Helsinki -tiimin matkan jatkumista!

[tallpiscesgirl]

Taiwan Excellence Ignites a Green Future and Business Opportunities at IGEM 2022

Taiwan Excellence Ignites a Green Future and Business Opportunities at IGEM 2022

Taiwan Excellence, an initiative by the Taiwan Bureau of Foreign Trade and managed by the Taiwan External Trade Development Council (TAITRA), has set up an exclusive exhibition pavilion at The International Greentech & Eco Products Exhibition & Conference Malaysia (IGEM 2022) with the theme “A Green Future” to spark business opportunities between Malaysia and Taiwan in sustainability. The venue…

[nightlyambiton]

Intentions

“The purpose of an intention is to be, rather than to arrive. It’s to align your actions with your belief whenever you have an opportunity.

An intention is a commitment to a process.

Intentions bring meaning into our lives now, so that we can navigate our lives based on what is as opposed to what may be.’’

Why?

What is my goal or resolution?

Pass my Fall 2022 classes without getting overwhelmed.

1. Why am I taking the classes?

To get a degree in chemical engineering.

2. Why do you want a degree in chemical engineering?

I enjoy the process of large scale production and systems

3. Why do you enjoy processes and systems?

Because of iGEM, thermodynamics I and fluid mechanics.

4. Why do you enjoy thermodynamics and fluid mechanics?

Because they teach me information on a macro and micro scale that build on each other to be functional in an ideal puzzle or problem.

What is your intention?

I intend to make my education a priority.

What are your goals?

Sleep 7 to 8 hours a night

Pass all exams

Actively take notes during lectures.

What is your plan?

Go to all lectures no matter what

Work on homework without chegg multiple times.

Go to office hours for questions rather than relying on Google.

[evoldir]

Fwd: Postdoc: TempleU.EvolutionaryGenomics

Begin forwarded message: > From: evoldir@web.rhpcs.mcmaster.ca > Subject: Postdoc: TempleU.EvolutionaryGenomics > Date: 15 April 2022 at 09:08:45 BST > To: rdmpage@gmail.com > > > > Multi-year NIH-funded support is anticipated for a postdoctoral researcher > in the Hey lab at Temple University.   Experience in evolutionary or > population genetic theory, particularly in  mathematical modelling > or statistical analysis of evolutionary genomic data, is desired. > The successful candidate will become a member of both the Center for > Computational Genetics and Genomics (CCGG) and the Institute for Genomic > and Evolutionary Medicine (iGEM) at Temple University. > > Project Description:  The primary focus of the research will be on > the development and application of improved analyses of selected and > neutral substitutions,  building on an approach first described in > doi.org/10.1073/pnas.2023575118 > > The salary will follow current NIH postdoctoral guidelines, based on > years of postdoctoral experience. Full benefits are included. > > Applicants should submit the following in a single document as an > attachment to hey@temple.edu: (1) a cover letter (include expected > completion date of PhD, if appropriate), (2) a CV, and (3) contact > information for three references. > > Temple is an R1 university, located in the heart of historic Philadelphia, > and is the sixth largest provider of graduate school education in the > USA. Situated in close proximity to New York City and Washington DC, > Philadelphia is the birthplace of America and home to many academic and > research institutions. > > Temple University is an equal opportunity, equal access, affirmative > action employer committed to achieving a diverse community. > > Jody Hey    hey@temple.edu > Director, Center for Computational Genetics and Genomics > Professor, Department of Biology > Temple University > 1900 N. 12th Street > Philadelphia, PA  19122 > > > Jody Hey > via IFTTT

[igememelek]

İgeme İhracatı Geliştirme Merkezi, 2022 -2025 vizyonu çerçevesinde Türk İhracat Merkezi ve Türk Sağlık Merkezi kurulumu için 5. hedef ülke Almanya Çalışması başlıyor. Almanya Ülke Direktörümüz İrem Duran bu proje kapsamında merkezlerin yerinin tespiti, şirket kuruluşu, organizasyon, ihracat ve sağlık turizmi paydaşları ile görüşmek ve saha çalışması yapmak için 12-17 Şubat Tarihleri arasında HAMBURG ziyareti gerçekleştirecektir. Bu çalışma programında paydaş, partner, çözüm ortağı ve iş birliği alanında görüşmek isteyen firma, temsilci ve sivil toplum kuruluşları ile birlikte olmaktan mutluluk duyarız. Siz de bu konularda İGEME ile Gateoftec ve MedicalinTürkiye projeleri hakkında bilgi almak görüşmek isterseniz, bize ulaşın. İrem Duran: +90 533 291 21 87 GSM- Mesaj - Whatsapp +90 212 236 00 24 irem.duran@igeme.com.tr #igeme #ihracat #export #import #hamburg #health #trade #tourism #germany #deutschland #türkiye #turkey #turkei #ithalat

[aaltohelsinki]

Last words before the Jamboree

Our IGEM project is slowly coming to an end and Wow, what a journey this has been. The year has been long and rich in stages, including many problems and overcoming them. One important part is still ahead: the Grand Jamboree conference in Paris! Next, some thoughts and moods about the past year regarding our project, and about the conference that awaits next week.

As said, our project is coming to an end. We believe that all members of our team agree that it feels good to finally start to feel relief and look back with pride at what the team has achieved this year. The awaited (and feared) Wiki-freeze (i.e. the final limit for our wiki page) is now behind us and you can now take a look on our website at: https://2022.igem.wiki/aalto-helsinki/. Although we think, we did the last edits at the very last minute, we got our page to look exactly as we wanted. There you can find all the scientific information about our project, so you should go and read it yourself!

But as mentioned, very soon we will be able to pack our bags and head towards the airport and Paris, because the Grand Jamboree, we have been waiting for the year, is about to start. However, it won't be a vacation trip, but instead a week including lots of presentations, the judging session, getting to know other projects, the award ceremony and hopefully free time for getting to know the competitors and networking with them. Naturally, the last few weeks have been busy and full of preparations for the judging session and other presentations. Our goal is not only to participate in the conference, but also to succeed there, and right from the beginning of the year we set our goals for a gold medal, i.e. meeting the highest criteria. So the gold medal does not mean the best project of the entire competition (which is also selected), but instead the fulfilment of certain criteria. That being the case, this competition is, above all, a competition against ourselves, aiming to perform as well as possible as a team.

Finally, we would like to thank all the parties who have participated and lived with our project during the year. Naturally, this includes the financial support of Aalto University and the University of Helsinki and the trust that as students we can accomplish something meaningful. Without this support, participating in this competition, let alone travelling to Paris on site, would not have been possible. In the same breath, we thank our private partners, from whom we have received, in addition to financial support, valuable resources for the project. In addition, during the project we received lots of help from our supervisors, advisors, mentors and Aalto-Helsinki alumni and other top experts in various fields, who have been our help and support in difficult moments and have given their own knowledge to solve our problems. A big joint thank you to everyone!

-----------------------------------------------------------------------------------------------------------

IGEM projektimme alkaa pikkuhiljaa olla lopuillaan ja vau mikä matka tämä onkaan ollut. Vuosi on ollut pitkä ja vaiherikas, sisältäen paljon vaikeuksia ja niiden ylitse pääsyä. Silti yksi tärkeä osuus projektia on vielä edessä, eikä mikä tahansa vaan nimittäin projektin päättävä Grand Jambore-konferenssi Pariisissa! Seuraavaksi hieman ajatuksia ja tunnelmia kuluneesta vuodesta projektimme osalta, sekä ensi viikolla odottavasta konferenssista. 

Kuten sanottu, projektimme alkaa olla loppusuoralla. Uskon, että kaikki tiimimme jäsenet voivat yhtyä ajatukseen, että tuntuu hyvältä kun vihdoinkin voimme alkaa hieman huokaista helpotuksesta ja katsoa taaksepäin ylpeinä siitä, mitä olemme tiiminä tämän vuoden aikana saavuttaneet. Odotettu (ja pelätty) Wiki-freeze (eli takaraja wiki-sivullemme) on nyt takanapäin ja nettisivuamme pääsee nyt ihastelemaan osoitteessa: https://2022.igem.wiki/aalto-helsinki/. Vaikka viimeiset muokkaukset taisimme tehdä aivan deadlinen viime hetkillä, saimme sivumme juuri sen näköisiksi kuin halusimmekin. Sieltä löytyy aivan kaikki tieteellinen informaatio mitä projektiimme tulee, joten kannattaa käydä itse sieltä lukemassa!

Mutta kuten mainittua, aivan pian saamme pakata laukkumme ja suunnata kohti lentokenttää ja Pariisia, sillä koko vuoden odottamamme Grand Jamboree on aivan tuota pikaa alkamassa. Mikään lomamatka siitä ei kuitenkaan tule, vaan edessä on kiireinen viikko, pitäen sisällään muun muassa projektimme esittelyn tuomareille sekä muille tiimeille, muiden projekteihin tutustumista, palkintojen jako sekä toivottavasti vapaata aikaa muihin kilpailijoihin tutustumista ja verkostoitumista varten. Luonnollisesti viime viikot ovat olleet tämän takia hyvin kiireisiä presentaatio- sekä muun materiaalin valmistelun takia. Tavoitteemme ei ole vain osallistua konferenssiin, vaan myös menestyä siellä ja jo heti alkuvuodesta asetimme tavoitteeksi kultamitalin, eli korkeimpien kriteerien täyttämisen. Kultamitali ei siis tarkoita koko kilpailun parasta projektia (joka sekin kyllä valitaan ja julistetaan), vaan nimenomaan tiettyjen kriteerien täyttämistä. Näin ollen tämä iGEM kilpailu onkin meille ennen kaikkea kilpailu itseämme vastaan, tavoitteena suoriutua itse tiiminä niin hyvin kuin mahdollista. 

Lopuksi haluamme vielä kiittää kaikkia tahoja, jotka ovat vuoden aikana olleet ja eläneet projektimme mukana. Luonnollisesti tähän kuuluu Aalto-yliopiston ja Helsingin yliopiston taloudellinen tuki ja luotto siihen, että opiskelijoina voimme saavuttaa jotain merkityksellistä. Ilman tätä tukea tähän kilpailuun osallistuminen, puhumattakaan paikan päälle Pariisiin matkustamisesta ei olisi ollut mahdollista. Samaan hengenvetoon täytyy kiittää myös meidän yksityisiä kumppaneita, joilta olemme saaneet taloudellisen tuen lisäksi muita projektimme kannalta korvaamattomia resursseja. Lisäksi projektin aikana apunamme olleet valvojamme, neuvonantajat, mentorit sekä Aalto-Helsinki alumnit ja muut eri alojen huippuasiantuntijat, jotka ovat olleet meidän apunamme ja tukenamme vaikeina hetkinä ja antaneet omaa tietämystään ongelmiemme ratkaisuun. Iso yhteinen kiitos kaikille!

[aaltohelsinki]

The final steps to the Jamboree

Hello once again, it is already October! This past Month we have been working hard on wrapping up our iGEM project in both wet and dry lab fronts. In the wet-lab, we were finally able to test our bioreporter, but have currently mixed feelings about the results that we are in the process of analysing. We were also able to run one full round of ribosome display. Our initial idea, prior to the completion of the ribosome display protocol, was to couple the method with NGS analysis so that it would allow for the identification of specific DARPin molecules and discover patterns in the DARPins that were able to bind to our AIP peptide (target). Ideally, such an idea would be of interest for future research applications.

After finishing our first round of ribosome display we sent our samples for sequencing at the Institute of Biotechnology. We finally got data from the sequencing unit for analysis! In brief, next-generation sequencing (or NGS) is a sequencing technology able to offer massive parallel sequencing to determine entire genomes or targeted regions of both DNA and RNA! For our project, we sent our tested wet-lab DARPin molecules for sequencing with the aim to determine successful DARPins and possible DNA patterns therein.

From our initial data analysis results, we were able to confirm the underlying quality of the reads as well as base pairs and possible contamination events. In addition, we were able to acknowledge the presence of both N- and C -caps as well as some of the internal repeats (IR) of our DARPins! Exciting work that we predict to complete within the next days. A sneak peek of our preliminary results can be seen from Figure 1.

Figure 1: Identification of the N-CAP RNA sequence from the NGS data.

Our project is indeed ending, which makes us sad and excited at the same time since we will be able to demonstrate and present our iGEM project in the Grand Jamboree in Paris later this Month. Thank you to all the readers who have been accompanying us throughout this journey, please stay tuned for more!

-----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Projektimme on loppusuoralla, mikä on toki surullista mutta samalla jännittävää. Pääsemme esittelemään iGEM-projektimme tuomaristolle 2022 Grand Jamboree-konferenssitapahtumassa, joka järjestetään lokakuun lopussa Pariisissa. Haluamme kiittää kaikkia teitä, jotka olette seuranneet matkaamme läpi tämän vuoden. Pysykää kuulolla, sillä lisää on vielä tiedossa!

Tervehdys jälleen! Ajatella, että nyt on jo lokakuu. Viimeisen kuukauden aikana olemme tehneet pitkää päivää saadaksemme iGEM-projektimme päätökseen niin laboratorion kuin dry labin puolella. Olemme muun muassa saaneet testattua bioreportterimme, mutta saamamme tulokset ovat aiheuttaneet hieman ristiriitaisia tunteita. Näiden bioreportteri-tulosten lisäksi olemme saaneet myös suoritettua yhden kokonaisen ribosome display -ajon. Alkuperäinen ideamme oli yhdistää tähän myös NGS-analyysi, jotta voisimme tunnistaa DARPin-molekyylit spesifisti ja löytää toistuvia elementtejä DARPineista jotka sitoutuivat AIP-kohdemolekyyliimme. Ihannetilanteessa tätä ideaa voisi kehittää ja soveltaa tulevaisuuden tutkimuksissa.

Ensimmäisen ribosome display -ajon jälkeen lähetimme näytteet sekvensoitavaksi Biotekniikan instituutille, josta saimmekin vihdoin dataa analysoitavaksi! Lyhyesti summattuna, NGS eli next-generation sequencing on sekvensointiteknologia, joka tarjoaa mahdollisuuden laajaan rinnakkaissekvensointiin. Tämän rinnakkaissekvensoinnin avulla pystytään määrittämään kokonaisia genomeja tai kohdealueita niin DNA:sta kuin RNA:sta. Projektiamme varten lähetimme laboratoriossa testaamamme DARPin-molekyylit sekvensoitavaksi, tavoitteenamme määrittää toimivat DARPinit sekä niiden mahdolliset DNA-elementit.

Alkuperäisistä data-analyysituloksistamme saimme tietoa mm. emäspareista ja niiden sekvensseistä (reads) sekä mahdollisesti tapahtuneista kontaminaatioista. Lisäksi pystyimme vahvistamaan sekä N- ja C-capien olemassaolon sekä osan DARPiniemme sisäisistä toistojaksoista! Tiedossa on siis innostavaa puuhailua datan parissa, jonka analyysituloksien odotamme valmistuvan seuraavien päivien kuluessa. Kuvasta 1 löydät pienen kurkistuksen alustaviin tuloksiimme.

[aaltohelsinki]

The end is near!

Hello once again and we are glad for the start of the autumn season! The 2022 summer came to a close but the work has not yet finished! We have been working hard to conclude our lab tasks during September whilst making our most significant advances thus far. Initially, we thought that our lab-workload would be less when the semester began. However, surprisingly, this month has been the most productive and intense we had – which makes sense in virtue of wrapping up everything!

Last week we were able to finally accomplish one of the biggest experiments of our iGEM project - the ribosome display method from start to finish in just a couple of days! It all began with the in vitro protein synthesis and ending with the passing of fully reverse transcribed samples to the Institute for Biotechnology for sequencing at the University of Helsinki. Currently, we are waiting for the final results to arrive and with such data we plan to discover the most effective DARPin molecule that binds to our target of interest (the AIP peptide).

Indeed, we did not manage to complete everything without certain setbacks and a few do-overs, but in the end, we successfully performed every planned task and we can proudly affirm that we did this challenging method during our time in the lab!

Extra assignments that have occupied our days and weeks include the workshop for children at Heureka in collaboration with the Aboa iGEM 2022 team, the Alumni sitsit, and a presentation in the Science Basement on the 23rd of September at 14.30 at Redi Kalasatama. In addition to our important events and collaborations, we are attempting to get our wiki texts ready prior to October and provide our programming team enough time to finish the wiki webpage before the final deadline.

As you can tell already, we had a crazy summer that extended into the autumn! Nonetheless, we are incredibly happy to be on this journey together and experience all of these feelings. The thought of our wet lab work coming to a close feels odd but at the same time we are very excited to get to present our iGEM final work next month during the Grand Jamboree in Paris!

________________________________________________________________

Hei taas ja ihanaa syksyä! Kesä 2022 tuli päätökseensä mutta tiimimme työ ei ole vielä loppunut! Olemme tehneet syyskuun aikana ahkerasti töitä saadaksemme tuloksia laboratoriokokeistamme ja olemmekin edistyneet tämän kuun aikana eniten koko vuoden aikana. Alunperin luulimme työmäärän vähenevän kouluvuoden alkaessa, mutta yllättäen tämä kuukausi on ollutkin produktiivisin ja intensiivisin. Ehkä tästä ei olisi tarvinnut yllättyä, kun yritämme kuitenkin tämän kuun aikana saada kaiken päätökseen.

Viimeviikolla saimme päätökseen yhden isoimmista tavoitteistamme iGEM projektissamme, suorittaen ribosomi näytön alusta loppuun vain muutamassa päivässä! Aloitimme in vitro proteiinisynteesillä ja päätimme kokeemme antamalla käänteistranskriptoidut näytteemme Bioteknologian Instituutille, jossa ne sekvensoidaan. Nyt odotamme tuloksia sekvensoinnista, sillä tulosten avulla pyrimme valitsemaan parhaan mahdollisen DARPin molekyylin joka sitoisi kohdemolekyyliämme (AIP peptidi).

Me emme toki selvinneet tänne saakka ilman muutamia takapakkeja ja uusia yrityksiä, mutta lopulta suoritimme kaikki suunnitellut vaiheet ja voimme ylpeänä sanoa, että onnistuimme suorittamaan tämän vaikean metodin labrajaksomme aikana!

Tämän lisäksi olemme edistyneet labrassa myös bioreportterimme kanssa, kun saimme vihdoin kloonattua molemmat reportterimme osat plasmidiin. Ensimmäisen osan kloonaaminen plasmidiin ja plasmidin onnistunut transformoiminen E. coliin kesti useamman viikon. Nyt bioreportterimme on vihdoin valmis ja voimme siirtyä seuraavaan vaiheeseen, jossa testaamme bioreportterimme toimintaa AIP molekyylien kanssa.

Muita lähiaikojen aktiviteetteja ovat olleet lapsille suunnatut työpajat Heurekassa Aboa iGEM 2022 tiimin kanssa, alumnisitsit ja esitelmä Science Basementin kautta 23. syyskuuta kello 14.30 Redissä Kalasatamassa. Tärkeiden tapahtumien ja yhteistöiden lisäksi pyrimme saamaan kaikki wikitekstimme valmiiksi ennen lokakuuta ja antamaan ohjelmointitiimille riittävästi aikaa viimeistellä wikisivumme ennen aivan viimeistä takarajaa.

Kuten varmaan tässä vaiheessa voi jo päätellä, meillä on ollut hurja kesä joka jatkuu vielä syksyyn! Kaikesta huolimatta olemme niin onnellisia päästessämme jakamaan tätä matkaa yhdessä ja kokemaan näitä tunteita. Labratyöskentelymme loppuminen tuntuu omituiselta, mutta samalla olemme kovin innoissamme päästessämme esittelemään lopputulostamme ensi kuussa Grand Jamboreessa Pariisissa!

[aaltohelsinki]

Hi there! I’m Mari, the head of Graphic Design for Aalto-Helsinki 2022. I was born and raised in a Finnish town, Sipoo, the countryside neighbour to Helsinki. I’m a first-year design student at Aalto Arts, but I also understand the fundamentals of natural science, thanks to my nearly finished Bachelor’s Degree in Food Science. That being said, my iGEM summer will include a lot of wet lab work! Besides the wet lab I’ll be working with Human Practices, social media, our team’s promotion video and writing as well.

In my everyday life I wish to have a positive impact on the world and people: I've always enjoyed helping others. In the future I want to design something necessary, sustainable, functional and hopefully aesthetic as well!

In my free time I enjoy various sports. I’m actually a part of the Finnish National Karate team, but outside the tatami I tend to do gym, running and horse riding. In addition to sports, arts and music are essential to me! 

When I was little, my parents convinced me that math skills are hereditary (still not sure how to feel about it).

------------------------------------------------------------------------------

Hei! Olen Mari, Aalto-Helsinki 2022 graafisen suunnittelun johtaja. Lapsuuteni ja nuoruuteni olen viettänyt Sipoossa, Helsingin maaseutumaisessa naapurikylässä. Opiskelen ensimmäistä vuotta muotoilua Aalto-yliopiston taiteiden ja suunnittelun korkeakoulussa, jonka lisäksi minulla on perustietämys luonnontieteistä elintarviketieteiden opintojen kautta. Tämä tarkoittaa sitä, että iGEM-kesäni tulee olemaan täynnä kokeellisen laboratorion töitä!  Lisäksi työskentelen Human Practises -aktiviteettien, sosiaalisen median, promootiovideon ja kirjoittamisen parissa.

Haluan arjessani vaikuttaa positiivisesti maailmaan ja ihmisiin: muiden auttaminen on ollut minulle aina läheinen asia. Tulevaisuudessa toivonkin voivani suunnitella jotain tarpeellista, kestävää ja toimivaa, kuitenkaan esteettisyyttä unohtamatta!

Vapaa-ajallani harrastan urheilua laidasta laitaan. Kuulun karaten maajoukkueeseen, mutta tyypillisesti tatamin ulkopuolella treenaan salilla, juoksen sekä ratsastan. Urheilun lisäksi taide ja musiikki ovat oleellinen osa elämääni!

Lapsena vanhempani uskottelivat minulle, että matemaattiset taidot periytyvät (en edelleenkään tiedä, mitä mieltä olla asiasta).